一、在商標(biāo)轉(zhuǎn)讓中，企業(yè)內(nèi)部自身問題所造成的糾紛，屬于民事法律糾紛的范疇，一般情況下需要當(dāng)事人通過司法訴訟程序來解決維護(hù)自己的權(quán)益。而作為行政主管部門的商標(biāo)局，一般不會(huì)介入此類糾紛。但是，如果該商標(biāo)的轉(zhuǎn)讓申請還是在商標(biāo)局轉(zhuǎn)讓審查進(jìn)程中的，方便當(dāng)事人主張自己的權(quán)利，對于此類商標(biāo)轉(zhuǎn)讓的糾紛問題，商標(biāo)局通常會(huì)給于當(dāng)事人一個(gè)合理的時(shí)限，當(dāng)事人應(yīng)該盡快通過司法訴訟來主張權(quán)利，超過該時(shí)限，商標(biāo)局仍然會(huì)繼續(xù)進(jìn)行相應(yīng)的正常商標(biāo)轉(zhuǎn)讓審查程序。一旦商標(biāo)轉(zhuǎn)讓申請被商標(biāo)局核準(zhǔn)公告后，則該商標(biāo)轉(zhuǎn)讓行為已經(jīng)事實(shí)產(chǎn)生法律效力。涉及到法律權(quán)限問題，當(dāng)事人只能通過法院的申請證據(jù)保全措施來暫時(shí)凍結(jié)該商標(biāo)轉(zhuǎn)讓后的權(quán)利實(shí)施，并通過訴訟書程序來解決相關(guān)商標(biāo)轉(zhuǎn)讓糾紛。

二、對于假冒、偽造的商標(biāo)非法轉(zhuǎn)讓問題，則需要通過當(dāng)?shù)氐墓膊块T以偽造印章、文書，非法侵占財(cái)產(chǎn)等進(jìn)行刑事鑒定，然后通過司法程序解決。

三、對于商標(biāo)局作出的“不予受理”、“不予核準(zhǔn)”等等行政決定的行政糾紛，可以向國家工商總局進(jìn)行反映或者行政復(fù)議，或者行政訴訟等途徑解決。

四、注冊商標(biāo)的轉(zhuǎn)讓只有在核準(zhǔn)公告之日起商標(biāo)受讓人才擁有該被轉(zhuǎn)讓商標(biāo)的全部法律權(quán)益，而在注冊商標(biāo)轉(zhuǎn)讓核準(zhǔn)公告之前，被轉(zhuǎn)讓商標(biāo)的實(shí)際權(quán)益仍然屬于商標(biāo)轉(zhuǎn)讓人。因此，關(guān)于商標(biāo)在轉(zhuǎn)讓申請審查進(jìn)行中的商標(biāo)權(quán)益問題，只能通過商標(biāo)轉(zhuǎn)讓雙方事先在商標(biāo)轉(zhuǎn)讓合同中進(jìn)行相應(yīng)的權(quán)利約定。為了保護(hù)雙方利益，在商標(biāo)申請前，轉(zhuǎn)讓人與受讓人最好能夠簽訂一份轉(zhuǎn)讓協(xié)議，協(xié)議中把上面列出的可能會(huì)涉及到的問題都一一做出說明，并到當(dāng)?shù)氐墓C處做出公證。